La Rectoría del Instituto Vicarial Jesús Maestro, es la encargada de orientar la ejecución del Proyecto Educativo Institucional y aplicar las decisiones del Gobierno Escolar.

Otras de sus funciones, son:

El Instituto Vicarial Jesús Maestro cuenta con una Política de Protección de Datos Personales, conforme a la Ley 1581 de 2012.